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楼主: xyklmu
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Cell stem cell最新文章:Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming     [复制链接]

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发表于 2011-4-13 10:52 |只看该作者
我个人感觉这篇文章做的很不错,包括了很多方面,不光是简单的重复,希望那篇文章能给我们些启发
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发表于 2011-4-13 12:59 |只看该作者
本帖最后由 临床干细胞 于 2011-4-13 13:00 编辑 ) _* Y8 Z, q, v
  M, }" O; L; g7 ]6 J
microRNA用来代替转录因子的想法,我们查一下本BBS去年的贴子,就有多位站友提出过类似的想法了,这篇文章可以说就是这么做的,
  Q& ^3 Y( G5 m; l/ j
& j( u% v+ a* U至于是不是造假,没有证据不好评说,但是,如果一个方法一个技术没有可重复性,那它的真实性必然受到质疑,当初韩国的黄禹锡在science上的造假,不是有人揭发他,而是其他人用他的方法做不出来,大家都在质疑,后来实在瞒不住才承认是造假了3 n1 \+ L6 \" ]4 r2 s- |2 t% @9 o
& P, k8 o# q) I4 z' G( g4 b3 D
所以说,造不造假与是否发在牛刊是否是牛人并没有必然关系,任何一名科研工作者,如果能从中找出让人怀疑的地方,大家讨论也有助真相被揭开
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发表于 2011-4-13 14:16 |只看该作者
是不是造假,裴端卿组的人一试不就知道了。如果结果真实的话,那实验的关键就在于诱导条件中加入VPA的操作了,相信用裴端卿组的iCD1 medium应该效率再高个数量级
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发表于 2011-4-16 01:44 |只看该作者
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本帖最后由 snokey 于 2011-4-16 01:47 编辑
! w2 |7 {% T: x/ J
; r2 x7 Y# A, N9 v( r' m7 ^回复 cicadacjk 的帖子
6 ]+ U( ?& l1 W  b4 F' D8 T% ?' ^6 R& H! R2 T' {  U
兄弟消息很准嘛。Deepa的文章出来了。难道是YM兄?哈哈

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发表于 2011-4-16 20:04 |只看该作者
回复 snokey 的帖子- z8 e  ~9 {5 ]& A
0 F( W' B+ Q/ T( v- X  _4 w
当时我看到Dlk1文章时就有同样的直觉了,当然希望不是如此,毕竟这样还是给别人留下不好的名声,何况得罪的是hochelinger和jaenisch这一派的人。  c5 z$ z  Y6 ^+ N' C4 `& y: _
% y; e1 ]+ f- \! s' t: E
呵呵,你肯定不认识我的,我还在国内的,只是恰巧认识Blelloch实验室的人。不过消息还有点不准确,之前有篇EMBO J的miRNA的文章,那个实验室也做了302 family的
) J6 I9 B/ `: Q; g! x- Y  h! O) \+ c' _" r
有时候逆转录病毒做不出来,不能说慢病毒就没希望,但这么高的效率,总应该有点苗头。最严格的重复,应该等拿到那实验室的质粒再说了。然后,他们的鉴定从客观来说还是比较少的,比如四因子的插入,细胞的品系都没有鉴定,也就是说无法排除污染,所以……通讯作者还是比较安全的。
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发表于 2011-4-20 10:52 |只看该作者
回复 cicadacjk 的帖子% ?2 A! R* C3 _

, j  o- }9 E3 e+ q# J说的是!ips领域圈地运动愈演愈烈啊。好在现在华人圈子也占据一席之地了。
3 @  h( Z5 H9 A6 `1 Q
3 [$ o( J; W/ H+ Z4 |4 v% ~( d6 ^3 e另:hochelinger和jaenisch是不是已经分道扬镳了?2 a% k/ R" ]( Q: A: o
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发表于 2011-5-6 17:05 |只看该作者
可怜的我,同一篇文章放在不同的帖子中,被我下了两遍,然后发现自己已经下过的。弱弱的问句,能不能把我的包包加回来呀。
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发表于 2011-5-18 09:59 |只看该作者
回复 xyklmu 的帖子
- z0 [& F: N: A* H0 P
5 z: Z/ |: i( f) O9 E别人已经用miRNA-302abcd诱导人的毛囊细胞形成ips cell.现在又添加一个miRNA-367,有新意吗?为什么还发在cell -stem cell?
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发表于 2011-5-18 11:36 |只看该作者
本帖最后由 gxmwzy 于 2011-5-18 11:38 编辑
! g8 l9 m+ X4 f3 f
0 g* w2 j/ L7 {! c" y3 j大家好,我是一个初学者,没做过细胞重编程方面的实验,也就看了几篇文献。看了这篇文章之后,不敢说有什么意见,不过有一些疑问,主要是关于VPA的。
0 Y* ^) w- A0 @) C& }& L3 e& i1.文章中提到在MEF中,miRNA302/367在VPA存在的条件下才能诱导重编程,效率比4F高两个数量级。并且引用了哈佛的2008年《Induction of pluripotent stem cells by defined factors is greatly improved by small-molecule compounds》这篇文献,说4F的诱导效率是0.2-0.8%。但是这篇文献我看过,其中说4F的诱导效率是0.03±0.02%,并且用的逆转录病毒。不知道两者的矛盾怎么解释。更重要的是,这篇文章中说VPA能提高4F的诱导效率超过100倍,但其本身不能诱导。但是本文却说miRNA302/367在VPA存在时下才能诱导重编程,唯一的解释是和4F相比,miRNA302/367具有独特作用,但更可能是解释是两者中其中有假。
8 {; b& J( z0 V+ Z8 A; s1 |, H$ H9 y2.本文说在人的成纤维细胞中,miRNA302/367可单独诱导重编程,并且VPA不能提高诱导效率,由于人细胞中本身缺乏VPA的靶点--HDAC2。作者在讨论中对两者的差异解释为细胞系之间的差异性。而《Induction of pluripotent stem cells by defined factors is greatly improved by small-molecule compounds》中表明,至少在MEF中(虽然不是人的细胞),VPA除了HDAC的抑制作用,还通过上调ES-特异的基因并下调MEF特异的基因来发挥其作用。& o! q/ D/ B6 h  V+ B9 {
3.由1和2得出,假定两篇文章都是对的,只能说由于细胞间差异,miRNA302/367在VPA存在时的诱导效率比4F高两个数量级,而这样高的效率很可能是因为VPA而不是miRNA302/367。但无论如何,个人总感觉两文之间有一些是冲突的。- @* a* Q' y+ C9 }
请高手指教。
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发表于 2011-5-22 19:37 |只看该作者
有上传哈佛那篇文章的没
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