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[讨论] 扩增质粒时的摇菌问题   [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-7-9 22:15 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
大家在扩增质粒(大提)的过程中,为了提高得率,摇菌时一般有什么具体办法?先用15ml离心管摇菌时用多少LB培养基,多少菌,摇多长时间?然后往大瓶里放多少菌,摇多长时间?大家指教一下
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沙发
发表于 2011-7-9 22:39 |只看该作者
我们喜欢用可以透气的摇菌管,有种BD的大概15ML的管子,具体货号不记得,它能透气,让E.coli长的密度高一些。加入的LB在5ML左右就可以。你说大抽的话,我建议用50ML管子菌液会多些,可以摇菌20ML。也可以用透气瓶盖的三角瓶,可以摇菌50ML-200ML不等,看你需要的量了。总之,我认为要得到多的质粒,就需要多的菌液,所以觉得透气培养比较好。至于接种密度和摇菌时间,我们一般按照1/20左右接菌,就是500UL接菌10ML LB培养基,摇菌过夜(16小时左右)。希望能对你有所参考作用。
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藤椅
发表于 2011-7-9 23:47 |只看该作者
大抽的话我一般都用大的锥形瓶的,瓶口用纱布封紧。摇菌最好不要超过16h,过了菌会老。加菌我按1:1000加,1ML+1UL的菌。大抽质粒太多了也不一定好,它柱子都是有一定的吸附能力的,而且裂解的时候菌太多了会裂解不完全,这些都会影响抽出质粒的量的。试剂盒里应该有建议的菌的量的吧。
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板凳
发表于 2011-7-10 01:59 |只看该作者
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回复 Temin 的帖子* Z$ C+ o# H: |/ ?0 t+ K; g2 d; Q

7 g8 V( w( m2 J4 N有的技师说摇4-5小时就行了,不然死菌太多,菌的生长也受抑制了,也有人强调要过夜摇菌,你怎么判断菌量啊?
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优秀版主 金话筒 新闻小组成员

报纸
发表于 2011-7-10 08:06 |只看该作者
正常是先挑菌落,于15或20的玻璃管内 5ml LB摇过夜,第二天,将5ML倒入250MLLB中,再摇过夜,基本上就可以了,提的量绝对够!注意均要加入抗生素,
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地板
发表于 2011-7-10 08:26 |只看该作者
回复 痞子的烟头 的帖子
/ o2 o4 u8 v& a3 C. D* X4 ^' H( L$ q
你是怎么判断菌量的

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发表于 2011-7-10 08:33 |只看该作者
回复 pla269 的帖子# y& ]( I+ |. l, K& k2 n

' S4 w6 [6 A9 q2 t0 a1 k我们正常的流程是:& o' u' C9 y  a' ~9 O- N
第一天,下班之前也就是5点钟接菌,37度震荡培养;
. u6 m1 u( `7 W# X第二天,上班的时候(9点钟)收菌,培养的时间也就是16小时左右。
1 C  {$ U0 k9 t2 T  E! K! a3 ]基本上是目测判断菌量的多少,很久没有测定过菌液的OD值,我忘了是0.6-0.8还是多少,你可以自己查一查分子克隆手册。凭着经验,看起来比较浑浊就差不多了,因为我提取质粒一般是用作细胞转染,按照我们以往的实验,都是大致这样的流程,所以没有很细致的去研究这个。/ ^( u- n- v6 B& C1 X. x) }  M
摇菌4-5小时的话,在我们这边不大合适,因为这样接下来还得抽提质粒和验证质粒需要花费2-3小时,那样一个工作日就排满了,有可能做不完还得加班。
' O1 Q% B! ^6 s5 U# k% I: E8 D我觉得在基础实验这一块,尤其是商品化试剂盒非常成熟的基本实验技术,第一次第二次认真参考实验手册,这样你就会得到自己的判断,如果只是简单的得到质粒作为后续研究使用,你大可不必拘泥于实验手册,毕竟每种菌、每种质粒有自己的特性,怎么方便实验流程怎么来。
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发表于 2011-7-10 08:50 |只看该作者
回复 pla269 的帖子
0 d2 d+ h( c& P* e+ `9 O
+ x& n+ ?5 ~- _* Q' Q# s. O测OD值,我们一般锥形瓶,100ml 1%接种量,你说的4-5小时应该是在对数期,OD应该在0.4-1.0之间,抽提质粒,我们一般是过夜培养12h即可,有时8-10小时。没有必要那么准确,主要是在你后面solution I II  III与你菌体比例要做好,你的抽提试剂盒上应该有写
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发表于 2011-7-11 07:22 |只看该作者
为了提高得率,先用15ml离心管3mlLB培养基摇菌过夜,然后吸取100ul去大摇过夜。
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优秀会员 金话筒

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发表于 2011-11-30 20:39 |只看该作者
其实摇菌的多少,要看你所用的试剂盒,你如果是大提的话,一般必须得100ml LB以上,所以,你只能用锥形瓶;如果中提的话(50~100ml菌液就行),你还是得用锥形瓶,因为一般的离心管都盛不了那么多的LB,有人想用50ml离心管摇50ml菌,这个是很不可取的,因为50ml管虽然可以盛下55ml左右菌液,但是加了50ml lb后,瓶子里面就没什么空间了,这样很不利于菌的生长,另外,这样摇菌的话也摇得不均匀;如果是小提的话(10ml就够了),那么用50ml离心管就行了。菌液是否摇好主要看其浑浊程度,有些人说摇菌时间太长会长杂菌什么的,我暂时还没有过,不过我个人觉得摇菌最后就是直接摇菌过夜,摇完之后如果有事不能立即提,可以拿出来放4度,那样菌液还是可以保存一段时间的
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