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请教大牛有人做过猪的BMP15启动子吗?请不吝赐教啊! [复制链接]

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楼主
发表于 2012-6-15 08:17 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 细胞海洋 于 2012-6-15 09:19 编辑
9 l4 [' T; a: X5 U8 O+ Q
2 q( z: }; j6 l) ~+ I- d5 G: H0 g有人做过猪的BMP15启动子吗?请不吝赐教啊!

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小小研究员

沙发
发表于 2012-6-15 09:19 |只看该作者
详细说一下你的问题吧

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藤椅
发表于 2012-6-16 01:32 |只看该作者
你是有启动子做不出转录还是启动子弄不到啊?
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板凳
发表于 2012-8-24 11:52 |只看该作者
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回复 weiyepan 的帖子
: e# J9 r$ J% j4 q9 z/ |* G9 m, S  t. [
1、猪的BMP15基因启动子序列是BMP15基因起始密码子ATG前的区域码?我找了ATG前 2000多bp的区域,在线预测启动子核心元件却没有,不知道是什么问题。% N# b# D- q# }. B* @' |( s$ x
2、引物设计的酶切位点和防止移码的碱基该怎样添加?有点头大。
/ k$ q# w* N2 |& V- }, L
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报纸
发表于 2012-8-24 21:49 |只看该作者
1. 是的,一般启动子集中在900~1500左右的区域,但也有在很上游调控的例子。不过在线的启动子预测一般是根据现有的数据库做的,单一个数据库做出来的结果不一定准确,你要先找对物种和Pol才能比较准确的预测出来。; R  p9 U' b) }
2. 启动子一般比较难扩增,主要是区域内部GC分布不均匀。我们设计是从ATG前的序列开始,往3'端1500bp左右,主要看Tm不要看长度,一对引物要比较平衡,温度差最好不要超过5度。剩下的酶切位点就往5'端加就行了,加上去的序列不用算Tm值。如果想提高成功率,可以往外设计nest引物,特异性也会高很多,Tm的选择也会丰富很多。另外,PCR的时候加入DMSO和Betain,会增加产量。
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地板
发表于 2012-9-14 10:04 |只看该作者
回复 weiyepan 的帖子7 R! R4 D; D$ {& U7 r
. v' d, I+ g( N
谢谢,受教了!
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