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楼主: w343989328
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表观遗传的一个的想法   [复制链接]

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发表于 2011-11-30 09:24 |只看该作者
很好的想法

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发表于 2011-11-30 10:06 |只看该作者
回复 cronos0910 的帖子1 N8 S/ S4 l0 i: J

2 w) L4 @% {, ~( w1 a! g+ t$ O' HIPS会偏向来源细胞分化,这个主要是在小鼠物种模式里面发现的,然而在human iPS里情况可能就不一样。有实验证据表明,human femal somatic cells(一条染色体失活)来源的iPS在体外诱导分化时,染色体失活是随机发生的;但是小鼠却依旧保持来源体细胞的失活染色体。所以现在的epigenetic还有待更多的研究。# C2 y; G) \6 ?- t+ l0 e- P" J) D
在做iPS时,cmyc是个致癌基因,故现在的研究者更多趋向于只采用3因子,相对而言安全性高一些。但是前段时间nature上提到及时这样,iPS的immunogenecity依旧不容乐观,即使是同体移植会稍微好些,但是产生的免疫排斥性根本无法在临床上得到进一步应用。
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发表于 2011-12-31 10:33 |只看该作者
回复 w343989328 的帖子
3 C: ?! h3 h' b9 _# J- W  Q3 ?2 @% G, a9 k8 A/ E8 @
楼主说的没错,很多基因并不能简单地用开启或者是关闭来描述,ES细胞中的很多基因是处于‘Poised’——也就是待开启的这么一种状态,此时的组蛋白修饰又呈现出一种双价的修饰,亦即同时存在着H3K27me3和h3k4me3的组蛋白甲基化修饰,而我们实验组在终末分化的成纤维细胞中,也发现一些极高拷贝的基因存在这么一些‘Poised’状态的拷贝,这些拷贝也有一些双价的组蛋白甲基化修饰,如同时存在着H3K27me3和h3k4me3的组蛋白修饰,另外,决定这些基因的开或者关的最主要因素是DNA的甲基化,当我们我诱导这些Poised基因的启动子产生高度的甲基化时,它们就被抑制了,也就是失去了带开启的这么一种状态。。。
( O5 @& |9 S* B. ^7 V所以,至少目前为止,被证实的基因状态,至少存在着Active,Silent,和Poised的这么三种状态,至于还有没有第四或者更多的状态,这就需要更多的发现来证明了。
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发表于 2012-1-20 14:26 |只看该作者
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精卵结合后的去甲基化机制已经被阐明,好像是前年的Nature发的,中国人做出来的,精子DNA是主动去甲基化,卵子DNA是被动去甲基化
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发表于 2012-1-20 14:27 |只看该作者
对于楼主的四种状态问题,idea不错,但仅仅适合于发育相关的基因,能否回答一下,有多少发育相关的基因?你就明白了
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发表于 2012-1-27 12:29 |只看该作者
回复 Tlexander 的帖子) L% v; a2 S0 x3 U# @+ U7 v

  ?) I3 R( k! d, C3 j8 a受精卵的详细去甲基化机制尚未明确,目前都说是跟5-hmC有关,但是去年年底cell的一篇有证明出来,5-hmC跟gene regulation有关,5-hmC会与MBD3 结合,也有人有证明出5-hmC会随着年龄增加.如果完全知道全基因体去甲基化的机制,那样就会很容易做出克隆人. 模拟全基因体去甲基化的机制,就可以用一个细胞让它转变为一受精卵,这样就不用iPS9 I" g, E" A% \" U6 v  _/ i$ E3 i
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发表于 2012-1-31 11:52 |只看该作者
克隆人这件事情太负责,就留给校友周琪去做吧,我在这边不能给出一些好的建议
6 O! S0 g0 }- z& e对于各种类甲基化的修饰的研究确实还需要继续透彻下去,从物理学上叫,如果各种状态都不明的话,状态之间的转换从何谈起,从一种状态推理另一种状态更无法谈起,那么对系统就行预测分析就更难了
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