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逆转录病毒的包装   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-11-17 08:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1.我有一个含目的基因的逆转录病毒质粒,想将该质粒包装成病毒后再感染细胞。由于之前从未做过病毒包装,我想请教一下群里的各位朋友,包装病毒的过程以及测病毒滴度难不难啊?是自己做好呢还是交给公司做? ' b; I  `( p  C3 }0 U, o! @
2.如果这个逆转录病毒质粒不包装成病毒,可以直接拿来转染细胞嘛?
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沙发
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
包装病毒并不难,一般用293T或293FT做转染,生产病毒,再感染目的细胞,我给你上传一份慢病毒和逆转录病毒的protocol,你看看,很简单。测滴度也不难,病毒感染293T细胞后的48h测,步骤如下: ①. 15万293T细胞48h即可刚好长至90-100%满,此时即可固定细胞,计数确定病毒滴度。5 i2 K% A! s+ @% {0 f
②. 将培养基用真空泵吸去部分,务必不要将其吸净,由于293T细胞易飘,固定及DAPI染色整个过程请务必保持293T细胞处于液面之下。用PBS涮3次。加入4% PFA室温固定30min, 24孔板每孔200ul。/ d) ^! t' W7 `- r1 f. F9 l' `
③.用PBT洗2次,每次3分钟。+ p6 {& \  I  }! o) g
④.PBS将DAPI 1000倍稀释,每孔加入200ul,避光室温静置5min。; w- h# B/ z3 ]4 b* R
⑤.PBS洗2次,每次5分钟,即可在荧光显微镜下计数,取2-3处取平均值。0 ~2 K3 I0 B8 h) u6 D
⑥.病毒滴度(IU/mL)=荧光细胞占总细胞数的百分比÷加入的病毒上清体积×1.5×10*5×10*3
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藤椅
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
Retrovirus / lentivirus infection protocol
/ x* n1 R8 B5 E( t) iD1: Seed HEK293T cells in 10cm dish (cell density should be ~80% confluency right before transfection)
$ u" F8 y* Z+ E, L  G*** Handle HEK293T cells gently to avoid detaching from dishes
1 d! \9 ^4 }# ]' r0 M) ?+ ~; MD2: After O/N incubation, transfect the following vectors with proper reagents (Fugene 6, Lipofectamine 2000, polyjet et al) following their instruction
* O2 F  R4 `2 tFor retrovirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Gag/pol, 1.5ug of VSVG
" Y: z/ y( K( P0 i* {For Lentivirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Δ8.9, 1.5ug of VSVG % c' x/ B7 N: ?
*** ~6 hours after transfection, change medium to fresh DMEM with 1% FBS supplied with P/S, and incubate at 37°C for ~48hs (two overnights)( H& A: _" r0 A. u8 `- _" [
D3: Seed target cells for infection in 6-well plate (60~80% confluency before infection)
/ n' o( N; s% V' H. Z) XD4: Collect viral supernatant from HEK293T cells into 15ml tubes
) \0 F3 T! A; W' O! `7 J5 y& J↓ spin down at 2000RPM for 3mins to remove cell debris
" ~5 O5 S! q- U+ }↓ pass the viral supernatant through 0.2um or 0.44um filter (called D1 virus)2 p! W; k2 J" I! j  e
↓ Wash cell in 6-well plate with 1XPBS5 [$ Z; ]/ H) h4 b- b! R# _, `  x1 J
↓ Add 1.5ml of filtered viral supernatant to target cells in 6-well plate, then add 8ug/ml of polybrene (by adding 1.5ul of 8mg/ml stock) " v. T- m8 z# y- h
↓ Incubate the cells in 6-well plate at 37°C for ~6hrs
8 u7 t6 `$ g5 @↓Add FBS or complete cell culture medium to make final FBS concentration close to ~10%' x. q1 p/ O9 m" p7 k
↓ Incubate at 37°C for overnight! ~1 q0 L1 Z5 E" ?
*** After collecting D1 virus, you can add more DMEM with 1%FBS into HEK293T cells and collect D2 virus after incubating overnight. But the D2 virus usually has lower viral concentration.0 n* j% T# Z4 I) M) K, X$ l
*** For retrovirus, you may need to repeat the infection for three times; for lentivirus, one time infection is enough in most of the cases.
; u9 X1 B6 P3 l$ N  N  ^*** The leftover of the viral supernatant can be stored at -80°C.2 c: S1 O: Y7 g5 l8 J6 n! d
D5: You may start selection with antibiotics if your cells don’t need further infection( k, ]% ?5 U) x& G( T! a. ~
*** You need to titrate the antibiotic concentration for selection in your cells ahead
! B0 }& c+ B5 @* N; {( f
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板凳
发表于 2011-11-17 09:57 |只看该作者
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回复 zhangtang 的帖子
( ?$ H8 b) _" x! p% F4 K. V' P, s( ]  U0 |
1如果有齐全的质粒,自己做病毒肯定没问题。! v: J5 N6 t, _) M- a7 \
2,质粒本身就可以用来转染,效率没有病毒高
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报纸
发表于 2011-11-17 10:38 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
/ c! b+ j5 e+ L. b1 v3 e) c
, {- `) d, T- Y) u你好,谢谢你给我的回答。我这个逆转录病毒质粒不含荧光,那如何在荧光镜下计数来测病毒滴度呀?
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地板
发表于 2011-11-17 10:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子: \. {) u, i  z. M1 d9 m

+ \7 k# q4 Z( O& L7 I# ^如果逆转录病毒质粒不含荧光,如何在荧光镜下计数来测病毒滴度?

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发表于 2011-11-17 21:42 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子
. T/ d3 `4 d5 w
# b' `3 D7 b* ?! `+ n你增加一个GFP的对照,通过GFP的来估算其他质粒
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发表于 2011-11-17 21:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
7 h8 |. @1 T7 `1 c- Q7 w/ I) H- F
, U3 u# q4 E- @) u( d# Y' w你好,你说增加一个GFP对照的话,是不是空白质粒flag也要包装啊?还GFP组就可以作为空白质粒对照组?
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发表于 2011-11-18 09:11 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子1 T. T& a/ P) e3 d; l* i  v

' p1 g# d7 ~5 X0 @- G1 G# b6 b6 z你转染的时候,多转染一个GFP,也就是GFP和质粒同时做,算出GFP的滴度,然后你质粒的病毒和GFP加的量一样多,这样不就行了么
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发表于 2011-12-13 08:47 |只看该作者
我的就是这个样子的,本身质粒没荧光,加一个GFP作对照!可是问题是我的包装细胞状态总是不好,包出来的病毒去感染293t荧光很不亮 而且很少 可以告诉我怎么个情况吗?谢谢啦!; `3 r7 T. t, z  S1 X5 D' K: V
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