Bisulfite genomic sequencing analyses甲基化测序的图是怎么做出来的？

ambassador

大家好，Bisulfite genomic sequencing analyses中分析启动子区甲基化程度的分析中，这种图是怎么画出来的？; Y  ^' y# L7 n7 S  O

2011-11-3 21:26 上传

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Bisulfite genomic sequencing of the promoter regions of

* H. U5 R: q& m2 A! e3 c+ s
! Q# X$ X6 V7 ]0 L$ O6 m
用什么软件分析？有什么软件或者网页分析可以自动生成吗？

ellapan

2011-11-4 01:34 上传

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甲基化

ellapan

晕 我记得这个问题我在本网上就回答了两遍了呀。 就是简单的word +powerpoint， 那些单独的圈圈你可以独立操作的，不过现在也有这种的 比较好看，我们现在采用上图这样的。

ambassador

ellapan 发表于 2011-11-4 01:36
, X/ S. P* ~, D% }4 Z晕 我记得这个问题我在本网上就回答了两遍了呀。 就是简单的word +powerpoint， 那些单独的圈圈你可以独立操 ...

: L- H* n8 t9 M- j- u: ~不是吧？我还一位用软件自动生成的呢？如我上面那个图，为什么一组有三列？分别代表什么意思？选取多少碱基来作图呢？还是这一组就是一个序列，分为三列更好看些？

exin11

回复 ambassador 的帖子9 `+ [- ^% z, i, `1 z
: t3 k0 C9 n7 B* f' U% ~7 c
这我已经发了，用软件http://www.stemcell8.cn/forum-vi ... D7%BB%F9%BB%AF.html
' n5 X' B8 ^% t! t9 Z( ?; \( O别用word+ppt，跟造假似的

ellapan

楼上的好像有些不对题了，因为就CpG位点分析而言肯定是要用到网络资源的，而楼主提供的图明显的是自己测序结果整理后才制作出来的图。

ambassador

exin11 发表于 2011-11-4 11:32 & _  P8 i; \1 k! |! n
回复 ambassador 的帖子
5 g3 u% j- s* ^" Z( [
4 \3 e0 U; ?# p% z1 B! a这我已经发了，用软件http://www.stemcell8.cn/forum-viewthread-tid-26601-highl ...

* x2 S1 i# E: |2 d1 ~太感谢了，我这得系统的看下了！

exin11

回复 ellapan 的帖子
( I% D5 e0 d7 Z7 {. Z, V7 A, _7 l+ v  s
不是的，这个测序图应该是将所测数据导入，自动生成，而不是说手工去画，你好好看看这些软件就清楚了。

embryonic12

回复 ellapan 的帖子3 H% ^; R& t1 h! a, e2 j
: N% I- p- C& s. m+ t
您好！4 N0 ?+ V. O/ U! C" K: V5 J
恳请详细指点一下用Word+ppt如何做出最终的图，得到图后又如何单存为TIFF格式？另外您上面那个图用什么软件制得？, L3 s; C; G* P9 F1 d7 I% a- h
苟能赐教，不胜感激！

ellapan

回复 embryonic12 的帖子2 \2 A  N- O+ W0 X. i" e- f# j
, {% F5 r) \6 U$ O9 y
好久没过来了 这个就是在ppt画圈圈 然后选择有无背景（实心和空心圈），另外exin11 建议你可以参考下，我已经好久不做甲基化这块了
9 R. S$ ^: u% A; L/ a5 z3 P