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本帖最后由 runsong 于 2011-9-12 22:18 编辑 , ?2 a% t) j( U/ h5 e$ E, A
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这是一个预测转录因子在DNA序列上结合位点的网络工具，可以预测与启动子区域结合的转录因子。
: \0 @; M. T$ n我是在 tonyp0720 的介绍下用了这个网站，虽然刚刚入门，但感觉不错，希望与大家分享，也在此抛砖引玉，望老手不吝赐教，同辈交流切磋。: g8 K7 R5 E5 Y' |' E
TESS是宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统 网址：http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
& T. _- ?) m, g+ y4 Y最简单的用法如下
% ]% c& K9 ?3 ~) Y+ d如图1：打开网址后，点击 site search4 D7 s9 V9 `" o& \: r* A
如图2：我是以CMV启动子为例说明用法，在2-1上输入序列名称；2-2上输入CMV启动子的序列；2-3中是网站保存预测结果的时间；2-4中输入你的邮箱地址，预测结果是发送到你的邮箱中的。点击 submit
2 v! x1 I# A+ X3 H' _如图3：之后的界面，此时预测结果已发送到你的邮箱中，如图4.有两个链接，第一个打开网站上的结果，第二个是结果的excel版本。
. |$ P$ |& R$ H6 |7 n3 H; o/ P! T如图5：打开链接的界面，是预测结果的基本信息。我们一般最关心的结果在 Poisson Significance ，点击它，界面如图6。上面就列出了与CMV启动子结合的转录因子。
. ?& } z4 ^, D9 P, ?, y" c# T$ h. ?7 z' a/ m8 X
其实网站上还有很多功能，我只会这么一点。详细用法可见附件文章。 |
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发表于 2011-9-12 21:49
发表于 2012-9-24 08:16
