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楼主: xyklmu
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Cell stem cell最新文章:Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming     [复制链接]

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楼主
发表于 2011-4-9 07:55 |显示全部帖子
本帖最后由 snokey 于 2011-4-9 08:06 编辑 5 i0 E0 D$ c0 Z$ L( M7 F
* H0 ?9 A/ y3 w! \) P
个人很不看好这篇文章,感觉too good too be ... 希望将来别的组能重复出来。& E1 d/ M/ s4 p; ^# M+ |
第一:做miRNA302/367的Lab太多了,用把这几个microRNA组合起来一起转染细胞,或者用载体表达整个microRNA cluster的工作很多人都做过了,我都知道一个很有Credit的(常有Nature level paper)的组做了好一阵了,没有得到什么非常非常明显的结果。
) k, w( B: N! n第二:关于ES-like 克隆的统计,按文章的统计方法来看,他们得到的人的细胞中的诱导效率差不多为10%(如果我没有理解错的话),我除了惊叹还是只能惊叹。& v4 d( v8 r+ W8 W
第三:VPA的作用问题,VPA的作用其实很大程度上是HDACi-indepent的,个人觉得作者的工作只能部分解释MEF里VPA的作用。) d% A5 K8 A& U3 X  T
第四:现在最流行的就是virus-free系统,病毒表达miRNA302/367可以work,直接转microRNA进细胞不就是virus-free/OSKM-free了吗?8 ^, e, {' i' T/ P* r3 J
第五:哈佛那篇靠合成mRNA高效诱导iPS的文章其实也有类似的问题(too perfect)。据我所知有公司重复了,结果很不乐观,实际上那篇文章真的很难重复。我个人一直有个很大的疑惑,关于Fibroblast转染的问题。众所周知,Fibroblast很难转,做过的人都知道,即使用优化的Nucleofection程序,转染效率不过50%,哈佛那篇用RNAiMAx(其实是弱化版的Lip2000)居然就可以搞定了?(而且是那么长的cDNA) 那样Lonza最有名的产品Nucleofector早就没有市场了。! v+ ]: Q( E) @" y; T) M0 T
6 ]6 N9 o6 n. g, U- B
个人觉得这篇文章值得借鉴的地方是找出了一些VPA可以提高诱导效率的解释。
4 h& Z7 y$ q4 e, w2 Z/ T时间/重复是最好的判断标准,希望我的观点是错误的。
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沙发
发表于 2011-4-9 09:39 |显示全部帖子
楼上的,你打算重复这篇文章吗?

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藤椅
发表于 2011-4-13 04:49 |显示全部帖子
昨天同一个大佬交流了一下,基本意见同cicadacjk的一样:假。最初我个人的担心是正对照(4F)用的病毒污染了只转microRNA的细胞。但后来仔细一想:如果只有microRNA诱导效率比3F or 4F低的话我觉得“似乎”有可能,但文章号称10%,我无语了。做过的同志都明白即使用间充质干细胞诱导,能有1%当相当的恐怖了。
  ]. G+ s: o- I% C  n- I9 D  L哈佛那篇我个人觉得基本也是假,只是假的比较巧妙/比较含蓄,泡泡没有那么容易破。这篇泡泡吹得太大了,应该爆得很快。7 D0 |- G, Y! y0 a! }

1 M- ^& j: W# D2 P+ \1 Y另外,个人严重cicadacjk说的“可知国内的文章在国外经受多大的压力”,不止中国人,当年的Yamanaka也是。做过的人都知道OSKM很容易重复,
! [! e# \0 f- j! MLin28/Nanog的那个组合简直就是......。到现在了Oct4/Sox2/Lin28/Nanog还要经常挂上KLF4/cMyc,美其名曰提高效率。呵呵: )
2 y0 ^, @& a! A0 {$ V; K) `: n5 `; X6 F  c
有件事情一直没说,今天一吐为快:
) [" l3 q2 q0 q* [" E7 W7 hAberrant silencing of imprinted genes on chromosome 12qF1 in mouse induced pluripotent stem cells  (Konrad Hochedlinger)
7 U) s+ ^8 E- M& G! @: tReceived 06 September 2009,  Accepted 17 March 2010,  Published online 25 April 2010 ) v# N1 U' G7 @

$ |- ^1 x% g5 Q; ]Activation of the imprinted Dlk1-Dio3 region correlates with pluripotency levels of mouse stem cells  (Qi Zhou组)9 C1 i) @% x' N+ y- |' J/ Y
Received April 8, 2010. Accepted April 9, 2010.
' P: |# r! a; E1 o5 |( |- g注意时间! 1 [" o6 a% O0 M# T  q& Z
和国内的组没有任何交集,不认识周组里的任何人,也没有听过任何八卦。但凭我的经验和直觉,特别是看到JBC(Received April 8, Accepted April 9)我想我大概明白了。希望我是小人之心。
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板凳
发表于 2011-4-16 01:44 |显示全部帖子
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本帖最后由 snokey 于 2011-4-16 01:47 编辑 % B" O' e6 Z& g8 @! y6 {* d+ r& Q  u+ {

8 u+ O; A8 l  Y8 T5 O0 X) I; R/ o回复 cicadacjk 的帖子8 R: @5 g+ v4 W+ l

- u2 e/ k1 N1 J8 D# a% L- o兄弟消息很准嘛。Deepa的文章出来了。难道是YM兄?哈哈
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