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请教关于Oct4-GFP MEFs问题 [复制链接]

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楼主
发表于 2013-4-2 14:07 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
想知道Oct4-GFP MEFs 背景.有人说是Oct4 启动子和GFP基因融合在一起,可是我在网上看到的是GFP基因在Ot4第5个外显子的下游.请教它的遗传背景. 还有,GFP是如何被调控表达的. 是内源的Oct4 调控还是外源的Oct4调控的?
9 Q. z6 |0 g, I& U! H8 hYamanaka四因子(OKSM)都参与细胞重编程的过程,为什么用Oct4 的表达就能代表着重编程细胞集落的形成,其他的三个因子不能代表吗?
+ S/ n. e+ {  M$ L  R! E最后一个让我很纠结的问题:在重编程的过程中,到底是外源的四因子起作用还是内源的四因子?在iPSC形成过程中,外源的四因子和内源的到底什么关系?; X7 F7 j* j) h/ z$ R
谢谢专家的指教。
7 a4 D: z1 |3 Y0 e# A
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沙发
发表于 2013-4-2 22:38 |只看该作者
照你说的,好像是Jax的Oct4-GFP小鼠。这种小鼠的Oct4基因终止密码子之后敲入了IRES-GFP的编码序列。IRES序列的作用是形成多顺反子,即一条mRNA编码多个蛋白,上游的蛋白翻译完成之后,IRES序列可以使它下游的编码基因继续被翻译出来。这样一来,当细胞内Oct4表达时,就会有GFP跟着表达,visualize了Oct4的表达,起到iPS细胞产生的reporter作用。对于你的问题,可以这样讲,Yamanaka四因子(OKSM)导入细胞,可以启动细胞内的多潜能基因调控网络,其中Oct4也是多潜能基因的重要一员,内源性Oct4的表达标志着细胞向iPS状态的转变。外源因子完成使命后就应该“沉默”,否则影响iPS的稳定。
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藤椅
发表于 2013-4-2 23:28 |只看该作者
按理来说应该是OCT4 promoter drive的,knockin的位点在染色体上,所以和外源性没什么关系吧。至于它的准确位置信息,去查一下老鼠的出处,或者做个PCR southern来证明吧。重编程过程中,首先起作用的当然是外源性的基因,转进去的基因通过一系列复杂的过程,改变细胞的表观遗传方式,从而使细胞获得多能性,标志性的就是内源性的OCT4开始表达。楼主不妨想一下,要是GFP是外源性OCT驱动的,那转了之后数个小时就会表达了,重编程的过程何需那么久?关于从外源性的表达到内源性的启动,正是重编程的机制,已经有很多文章报道这一过程并给出自己的模型,楼主可以找找
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板凳
发表于 2013-4-3 03:18 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
回复 damaoshu 的帖子
3 |5 `& t8 a/ A5 Q" V1 _" H% Y
, k/ ?, r& z- ]4 |1 z7 i5 C/ }- b谢谢你的回答.
% q! t, f: x# k; ]6 {( j, C8 gOSKM四因子今人体细胞(MEF)后,启动多潜能基因网络,改变染色体结构,使基因处于开放状态,这样这些重编程因子就可以就可以和基因调控元件结合,促使多潜能基因的表达。外源因子完成使命后是如何沉默的?
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报纸
发表于 2013-4-3 03:30 |只看该作者
回复 w343989328 的帖子7 O: c; E" f  ?/ }. O; n& d

+ q' A7 l8 H5 U. h/ Y& \谢谢你的回答。
7 z4 C" k1 q5 C; X既然是内源Oct4驱动GFP的表达,那么它是如何驱动的呢?. c, ^  T4 O3 S, U+ X* Q; ?/ p; y
Oct4是自己可以驱动自己的表达也可以驱动其他的三个因子的表达的。5 F/ S0 d$ Z. y" @
如果外援不能直接驱动内援的表达,那么外援就是驱动别的转录因子表达或者改变Oct4基因所在染色体结构然后促使Oct转录的因子结合在它的启动子上,内援的Oct连同GFP报告基因表达了。这种状态也是iPSC成熟的状态了.是这种可能吗?9 b& w+ Z: _* u
关于重编程机制我没有看到一个明确的说到外援和内援关系的。
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地板
发表于 2013-4-3 03:31 |只看该作者
回复 chutu 的帖子
' K* P# ^' R7 g3 T4 }  Q5 n6 K: i! W- O/ }5 B8 u$ p
谢谢你的回答.( z, N9 u. J2 h( n+ W" V9 \( ?1 V
OSKM四因子今人体细胞(MEF)后,启动多潜能基因网络,改变染色体结构,使基因处于开放状态,这样这些重编程因子就可以就可以和基因调控元件结合,促使多潜能基因的表达。外源因子完成使命后是如何沉默的?
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发表于 2013-4-3 14:25 |只看该作者
早期做iPS用的是逆转录病毒载体将OSKM导入细胞,其启动子容易自发沉默,可能是被甲基化修饰的结果。
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发表于 2013-4-3 15:05 |只看该作者
回复 damaoshu 的帖子
$ s6 A9 `% G. {# v" f+ s" p  ~; s# e$ [& B% ]' |
因为GFP是连在内源OCT4启动子下游嘛~那内源性OCT4表达的同时GFP也就表达了。至于这里的内源性和外源性OCT4,并不是简单的一对一的关系,内源性OCT4的表达是几个因子共同的结果,中间涉及的过程叫重编程。这一过程持续好多天,其终点是细胞获得多能性,这一多能性的标志就是内源性OCT4的表达,如果是OCT4-GFP的话,就直观体现在GFP表达。6 ^4 @& i$ m8 {2 }! ^7 F
你如果要探讨从外源到内源的过程,可以找一下一些文章。
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