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逆转录病毒的包装   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-11-17 08:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1.我有一个含目的基因的逆转录病毒质粒,想将该质粒包装成病毒后再感染细胞。由于之前从未做过病毒包装,我想请教一下群里的各位朋友,包装病毒的过程以及测病毒滴度难不难啊?是自己做好呢还是交给公司做? + T- r  @2 r: R
2.如果这个逆转录病毒质粒不包装成病毒,可以直接拿来转染细胞嘛?
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沙发
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
包装病毒并不难,一般用293T或293FT做转染,生产病毒,再感染目的细胞,我给你上传一份慢病毒和逆转录病毒的protocol,你看看,很简单。测滴度也不难,病毒感染293T细胞后的48h测,步骤如下: ①. 15万293T细胞48h即可刚好长至90-100%满,此时即可固定细胞,计数确定病毒滴度。
# n4 C0 ?  z6 p6 P0 w& t ②. 将培养基用真空泵吸去部分,务必不要将其吸净,由于293T细胞易飘,固定及DAPI染色整个过程请务必保持293T细胞处于液面之下。用PBS涮3次。加入4% PFA室温固定30min, 24孔板每孔200ul。
& l. i; \7 V$ h) _* n③.用PBT洗2次,每次3分钟。
8 _6 e7 ~+ X! r- X' R& w9 m④.PBS将DAPI 1000倍稀释,每孔加入200ul,避光室温静置5min。! q. ?/ `1 ~; Q7 v2 y$ x
⑤.PBS洗2次,每次5分钟,即可在荧光显微镜下计数,取2-3处取平均值。: |( ]2 o7 e: j
⑥.病毒滴度(IU/mL)=荧光细胞占总细胞数的百分比÷加入的病毒上清体积×1.5×10*5×10*3
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藤椅
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
Retrovirus / lentivirus infection protocol! f( o& e2 ]4 I" |/ D4 A! |' r) ~
D1: Seed HEK293T cells in 10cm dish (cell density should be ~80% confluency right before transfection)
. S! V5 z  ]0 r1 }- u6 L*** Handle HEK293T cells gently to avoid detaching from dishes + r9 V) q& C$ }8 G' E' S' ^1 t0 R  X5 _
D2: After O/N incubation, transfect the following vectors with proper reagents (Fugene 6, Lipofectamine 2000, polyjet et al) following their instruction
. o+ g7 `' [" H. N/ YFor retrovirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Gag/pol, 1.5ug of VSVG
9 {& F* B9 g' @+ dFor Lentivirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Δ8.9, 1.5ug of VSVG
# k0 f% k) \+ P5 r5 ^*** ~6 hours after transfection, change medium to fresh DMEM with 1% FBS supplied with P/S, and incubate at 37°C for ~48hs (two overnights)
+ [9 g: o4 R, a8 h. N# a$ iD3: Seed target cells for infection in 6-well plate (60~80% confluency before infection)
! ?: C+ h9 A2 j  [, v. F7 iD4: Collect viral supernatant from HEK293T cells into 15ml tubes
/ `0 V7 Y- |$ y5 j- o' R↓ spin down at 2000RPM for 3mins to remove cell debris
2 f; y7 @/ _( g% {+ _↓ pass the viral supernatant through 0.2um or 0.44um filter (called D1 virus)
4 L. e( k) f3 I↓ Wash cell in 6-well plate with 1XPBS
+ O  i1 V4 {/ u+ j+ ~" `2 ?↓ Add 1.5ml of filtered viral supernatant to target cells in 6-well plate, then add 8ug/ml of polybrene (by adding 1.5ul of 8mg/ml stock)
6 z' V/ b2 A6 s6 \1 A↓ Incubate the cells in 6-well plate at 37°C for ~6hrs
" k0 ?9 m$ f+ c* D) i1 @8 q5 J↓Add FBS or complete cell culture medium to make final FBS concentration close to ~10%, ?! r7 `- o; j) G+ w& P
↓ Incubate at 37°C for overnight* o! F* U* r  _; F* L8 f
*** After collecting D1 virus, you can add more DMEM with 1%FBS into HEK293T cells and collect D2 virus after incubating overnight. But the D2 virus usually has lower viral concentration.
2 H7 ^! T5 P( a- i, x*** For retrovirus, you may need to repeat the infection for three times; for lentivirus, one time infection is enough in most of the cases.
$ r: H& K- u1 c) o: t  O/ P) s*** The leftover of the viral supernatant can be stored at -80°C./ [8 R) i0 C, c+ y6 b7 x6 o
D5: You may start selection with antibiotics if your cells don’t need further infection7 Z) {" D- A( J. @& q, V
*** You need to titrate the antibiotic concentration for selection in your cells ahead* k+ U" e& r5 A2 K8 r8 z' Y
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板凳
发表于 2011-11-17 09:57 |只看该作者
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回复 zhangtang 的帖子
# b4 [$ D! |( h) }8 L2 l
2 W4 W" G! d  |: e% _, k5 E1如果有齐全的质粒,自己做病毒肯定没问题。% Z, }" Q' _( M  X$ g! B+ \( r0 }
2,质粒本身就可以用来转染,效率没有病毒高
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报纸
发表于 2011-11-17 10:38 |只看该作者
回复 momocy 的帖子$ [3 S7 C4 c2 y

( g+ L! k+ o. a/ v0 H& E你好,谢谢你给我的回答。我这个逆转录病毒质粒不含荧光,那如何在荧光镜下计数来测病毒滴度呀?
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地板
发表于 2011-11-17 10:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
! Q& I6 w) i% @+ B# `* o1 @& }4 T; O; ]% h- R7 O% h
如果逆转录病毒质粒不含荧光,如何在荧光镜下计数来测病毒滴度?

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发表于 2011-11-17 21:42 |只看该作者
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! r+ _: X2 T! M. c5 w* q. m4 q4 K' z8 H! X* S. @1 b2 X( t; R& C! I
你增加一个GFP的对照,通过GFP的来估算其他质粒
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发表于 2011-11-17 21:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
, X% m6 p0 L" `- s; B
2 O$ I6 Y& T) B+ D你好,你说增加一个GFP对照的话,是不是空白质粒flag也要包装啊?还GFP组就可以作为空白质粒对照组?
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发表于 2011-11-18 09:11 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子. Q( d6 `2 ]. H5 D
3 b/ V$ ?4 K6 p% ], X7 M8 M# g
你转染的时候,多转染一个GFP,也就是GFP和质粒同时做,算出GFP的滴度,然后你质粒的病毒和GFP加的量一样多,这样不就行了么
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发表于 2011-12-13 08:47 |只看该作者
我的就是这个样子的,本身质粒没荧光,加一个GFP作对照!可是问题是我的包装细胞状态总是不好,包出来的病毒去感染293t荧光很不亮 而且很少 可以告诉我怎么个情况吗?谢谢啦!
1 }! `; ]6 ~0 o+ i
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