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Cell stem cell最新文章:Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming     [复制链接]

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楼主
发表于 2011-4-8 09:25 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本帖最后由 细胞海洋 于 2011-4-13 10:00 编辑 - [; l5 H; Q: t- M; A% ^

: X* ~4 E& I" Q& xCell stem cell Volume 8, Issue 4, Pages Pages 376-388 (8 April 2011)   
( F8 {  w+ g# T0 y% D- x; D, Y" ?
. V. }+ d' B. r) s7 D" }, ]Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming of Mouse and Human Somatic Cells to Pluripotency
8 y' {3 [7 r$ V+ G; W7 r- m4 y/ X6 Z7 J2 K  ~2 h
$ S: K/ ?3 \; V* q5 y, Q
Frederick Anokye-Danso, Chinmay M. Trivedi, Denise Juhr, Mudit Gupta, Zheng Cui, Ying Tian, Yuzhen Zhang, Wenli Yang, Peter J. Gruber, Jonathan A. Epstein, Edward E. Morrisey" `3 h" Q+ V+ }7 [3 _! }
" L8 `+ w& w- b8 W6 `
Highlights
# }# F: ^9 H/ |► miRNAs alone can reprogram somatic cells to pluripotency 1 D6 m9 I2 a5 C# U
► The miR302/367 cluster reprograms both mouse and human fibroblasts
. N% \% S. \, r► miR367 is required for miR302/367 reprogramming
0 s7 F9 W" i1 d► Low Hdac2 levels are required for miR302/367 reprogramming
8 A  ]; Y1 C' ^4 b3 A6 x6 H) c' |0 U4 f1 w

; K3 G' Q( u: O5 ^$ C- r. w  r2 U1 i# H3 I% ]5 p9 A1 t4 X

$ D' ?9 Q" V  u, ~# B
3 s  n8 b* q7 p% M
: z) ^* i- R% O, n9 j6 Y现将这篇文献及附件信息贴上,欢迎大家进行讨论。" A4 z+ j  _! |3 |5 z

, L8 O5 s+ b* K2 Q$ l3 }8 M6 I海洋注:本文跟帖中有很多不同意见 本文是否存在作假可能 欢迎大家参与讨论 发表自己的观点4 p+ _& z5 _. `8 f" L2 K2 t
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沙发
发表于 2011-4-8 09:34 |只看该作者
2010年Science杂志总结出的10大科技进展中,有关细胞重编程的描述:
% s1 R6 G. U& G" w& I  j/ G$ A. X
Souped-Up Cellular Reprogramming
; f' T" t$ Z5 t$ _+ W  B' @! l
5 }; {& ^& ?( N/ AChanging a cell’s fate by adding extra copies of a few genes has become routine in labs around the world. The technique,
# T+ ~  @! d2 ^9 I. B* R; z; \known as cellular reprogramming, allows scientists to turn back a cell’s developmental clock, making adult cells behave
& E6 Z+ Z' m  F9 [9 `, Clike embryonic stem cells (see “Insights of the Decade,” p. 1612). The resulting induced pluripotent stem cells (iPSCs)  n& `, A: X, \0 A2 v5 ]* T9 @
are helping scientists to study a variety of diseases and may someday help to treat patients by supplying them with genetically
1 b4 m2 \# f- d3 Rmatched replacement cells.8 ~) e8 I/ b) y% k9 H! N
This year, scientists found a way to make reprogramming even easier using synthetic RNA molecules. The synthetic RNAs! [. [3 `* Y% C) t& ^1 z) }6 m! M1 h0 d
are designed to elude the cell’s antiviral defenses, which usually attack foreign RNA. The technique is twice as fast and 100 times5 o  K( i( d3 a2 s* T# A9 B" N
as efficient as standard techniques. And because the RNA quickly breaks down, the reprogrammed cells are genetically identical
. g4 N, T. ~3 {9 m$ p% C# Mto the source cells, making them potentially safer for use in therapies.
+ y6 X5 D( S' Z, `- q9 p8 K. |, O0 s& r" n
Early evidence suggests that the RNA approach reprograms the cell more thoroughly than other methods do, yielding a6 B* k/ ~' W' M9 s7 e( E+ I1 D
closer match to embryonic stem cells. The method can also prompt cells to become nonembryonic cell types. By inserting synthetic; A5 i  j4 ]- C. c  |% o$ J6 V! j
RNA into a cell that codes for a key gene in muscle tissue, for example, the researchers could turn both fi broblasts and iPSCs into muscle cells.

& O! r2 O7 F; c! N3 n- k( ]4 {6 E编者对具有调控的RNA分子在细胞重编程中的作用的预言,这么快就实现了,呵呵,说不定就是文章的作者提前透露出来的消息呢。
5 P" @% x# k2 Z, X- J
3 h* J5 J  T% @) ^$ H! `& f, ^5 f
1 r) A! l( ]# z" A
/ A( a, J% C" o  ?# P
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藤椅
发表于 2011-4-8 21:20 |只看该作者
本帖最后由 markllq 于 2011-4-8 21:21 编辑 , K% j" i8 I3 I/ d
0 X. _# M( I) p

' N7 j* c9 |' e- H. M这篇文章中利用miRNA302/367 在除去SKOM的情况下直接诱导出iPS,而上个月中科院广州生物院裴端卿组在JBC发表利用miRNA302/367显著提高了iPS效率,两篇文章的区别就在有没有加四因子诱导,最后发出来的文章差别很大,国内科研在创新方面还是不够给力啊!3 Q/ `1 Y! d) G' x" N: j

; D& j" P1 w$ r$ b) q附上裴的文章:
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板凳
发表于 2011-4-8 23:56 |只看该作者
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1)两篇文章在如何诱导iPS产生的方法方面没有太大的区别,cell stem cell这篇文章用的慢病毒的方法,而裴用的逆转录病毒,后者在感染效率上会略输一筹的。所以前者的作者一直在强调诱导的高效性,两个数量级以上。
6 m/ a( M9 p, c9 Z# a5 \* ]: O; a2)纵观两篇文章,cell stem cell这篇文章在分析诱导出来的iPS表型marker上做足了功夫,包括including pluripotency marker expression, teratoma formation, and, for mouse cells, chimera contribution and germline contribution.这一点裴的文章似乎有点单薄,他们对MET似乎更情有独钟。
* M: F' j+ v9 ~/ }' q* p4 j* ^3)cell stem cell这篇文章还对miRNA302/367发挥作用时的协同因素Hdac的表达水平进行了分析,从调控的网络性方面更深入了一步,裴做的也不错,找到了miRNA302/367的靶标。
" A- Q& s% Y: Z+ v9 b总体上感觉还是前者的分析比较到位也有深度,我们能够做出来同样的结果,在这一步上可能就有所不及了,个人愚见,呵呵
' I- c( l, y" E5 Z: a  y, k6 y, V' P+ }: f4 h/ |+ g- f2 d
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报纸
发表于 2011-4-9 07:55 |只看该作者
本帖最后由 snokey 于 2011-4-9 08:06 编辑
& ^! a4 Y/ `  Q/ |) K% `
. N, F: v2 {* W- C, z8 N  M$ `2 D个人很不看好这篇文章,感觉too good too be ... 希望将来别的组能重复出来。5 u4 ]. B% o! d) r+ y8 r
第一:做miRNA302/367的Lab太多了,用把这几个microRNA组合起来一起转染细胞,或者用载体表达整个microRNA cluster的工作很多人都做过了,我都知道一个很有Credit的(常有Nature level paper)的组做了好一阵了,没有得到什么非常非常明显的结果。/ J" e! ^0 f* \3 |$ Q# r. ~# f! U
第二:关于ES-like 克隆的统计,按文章的统计方法来看,他们得到的人的细胞中的诱导效率差不多为10%(如果我没有理解错的话),我除了惊叹还是只能惊叹。+ U5 U! l6 h+ ?
第三:VPA的作用问题,VPA的作用其实很大程度上是HDACi-indepent的,个人觉得作者的工作只能部分解释MEF里VPA的作用。
- a' Z" s( Q- J( v( \6 {: o, y! \第四:现在最流行的就是virus-free系统,病毒表达miRNA302/367可以work,直接转microRNA进细胞不就是virus-free/OSKM-free了吗?
! K  j. g" j# v/ n% V: M1 j5 z3 Q5 p: E* `第五:哈佛那篇靠合成mRNA高效诱导iPS的文章其实也有类似的问题(too perfect)。据我所知有公司重复了,结果很不乐观,实际上那篇文章真的很难重复。我个人一直有个很大的疑惑,关于Fibroblast转染的问题。众所周知,Fibroblast很难转,做过的人都知道,即使用优化的Nucleofection程序,转染效率不过50%,哈佛那篇用RNAiMAx(其实是弱化版的Lip2000)居然就可以搞定了?(而且是那么长的cDNA) 那样Lonza最有名的产品Nucleofector早就没有市场了。8 r# g4 k6 E* T4 f) o4 e
9 g' @! a7 j1 W: g) G
个人觉得这篇文章值得借鉴的地方是找出了一些VPA可以提高诱导效率的解释。
- }) u1 D; X4 o( N# C8 b时间/重复是最好的判断标准,希望我的观点是错误的。
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marrowstem + 10 + 10 我很赞同
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地板
发表于 2011-4-9 09:08 |只看该作者
我们也试过哈佛的那个方案,很难重复,文献就是个文献,科研还得自己做
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发表于 2011-4-9 09:39 |只看该作者
楼上的,你打算重复这篇文章吗?

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发表于 2011-4-9 14:49 |只看该作者
有这篇同一期的文献没?0 W4 ?/ i; t: u" y  q2 M/ @$ n$ Y
Defects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Development of Cloned Embryos Generated by Somatic Nuclear Transfer
0 s4 q4 n' I* O( o% WJiangwei Lin1, 2, Linyu Shi1, Man Zhang1, Hui Yang1, Yiren Qin1, Jun Zhang2, Daoqing Gong2, Xuan Zhang1, Dangsheng Li3 and Jinsong
6 o0 N6 w) T9 e( J2 Z+ X
& g6 e, ]1 U; W3 D7 j: b$ \$ J链接附上:http://www.sciencedirect.com/sci ... e8161f55c5940736b7e
- x2 z# F# f! b4 p+ Z$ x# z3 n: r/ f  ~+ H; `. S3 I, L
各位朋友:帮忙下载一下!

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发表于 2011-4-9 23:01 |只看该作者
回复 ambassador 的帖子
/ }# w5 o* \$ o, U6 r
' M8 ^! @0 k( JDefects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Development of Cloned Embryos Generated by Somatic Nuclear Transfer # P& h" q% D% X3 G# x* b/ R
- Q6 B; n1 P8 P- l

- F0 z& E, ?' d  ?3 P7 S# }, V# ~1 L; }! p( {
, g. _" h" U) N2 K

, a4 P1 m3 ?% @! k. H- N下载好了,楼上的可以下载了
3 b) r. w7 C! |3 A+ o+ ?; O7 ^3 ?
( |5 Z4 U4 J$ z$ [1 o! {/ M. n2 f& V0 k
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ambassador + 5 + 10 谢谢你的帮助!

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发表于 2011-4-9 23:08 |只看该作者
xyklmu 发表于 2011-4-9 23:01
" w0 _; m2 s# u  M: @; ^% a回复 ambassador 的帖子
+ H* a' c! A: n6 \' ?) O5 t6 f: `0 V, b! B, M
Defects in Trophoblast Cell Lineage Account for the Impaired In Vivo Develop ...
- O8 p; X, I1 M  }
谢谢啊!虽然同学发给我了。。。
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