我国科学家开发新技术，极大提高单细胞测序性能

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来源：科技部 2021-01-13 12:10' N" Z9 H: M4 z' s1 X4 d

  V. o: u+ {4 u+ n# M  t单细胞全基因组测序（WGS）对于表征DNA中动态细胞间变化至关重要。当前用于单细胞WGS的样品制备技术复杂，昂贵，并且存在高扩增偏差和误差。, J; }: x+ D$ ~( e
厦门大学杨朝勇团队在Science Advances 在线发表题为“Digital-WGS： Automated， highly efficient whole-genome sequencing of single cells by digital microfluidics”的研究论文，该研究描述了Digital-WGS，这是一个样品前处理平台，可基于数字微流体的自动处理功能来简化高性能单细胞WGS。4 g3 v8 i. t& a9 ]- z9 D/ ?
数字微流控（DMF）是一种新兴的微流控自动化技术，可通过电介质上电润湿现象处理电极阵列上微升至纳升大小的液滴。该研究开发了Digital-WGS，这是一种基于DMF的单细胞样品制备平台，该平台集成了并行纳升体积多重置换扩增（MDA）的所有主要步骤，包括从单细胞分离到全基因组扩增（WGA）的自动处理。通过在DMF芯片上结合流体动力学和表面润湿性，无论细胞类型和输入如何，都可以通过液滴操作自动有效地（100％）分离单个细胞。Digital-WGS允许在所有步骤中对液滴进行可寻址的控制，以大大提高裂解效率和反应的均匀性。可寻址和非接触式工作流程减少了与污染物或内源性背景的竞争，从而提高了基因组模板的有效浓度。
3 ~$ v) T! R1 Y8 F$ X该研究应用Digital-WGS进行了许多单细胞纳升体积的MDA反应，并使用低深度和深度全基因组测序将性能与其他已报道的MDA方法进行了全面比较。该结果表明，Digital-WGS在多个方面都优于现有的MDA方法，从而大大降低了放大偏差和指数放大误差。使用该方法，该研究能够以最小的150 kb bin和等位基因剔除（ADO）率为5.2％的单核苷酸变体实现出色的检测。因此，Digital-WGS提供了解决WGA当前问题的独特途径，从而为执行单细胞测序提供了一种有效而强大的方法。这种方法对于单细胞分析的任何化学方法都具有可扩展性和通用性，这对于单细胞基因组测序有广阔的应用前景。(生物谷Bioon.com）# G. A, c( f% s6 W9 C, R3 r9 P' d' t
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