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[请教] 求助,已知我所要的蛋白的大小,如何确定该蛋白种类? [复制链接]

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楼主
发表于 2015-10-6 14:28 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
如题,想知道该蛋白的大小,但不知它是什么,同学给推荐了一个GO数据库,但是用着不是很方便,估计也是我没太搞明白,想问下大家还有没有其他的方法能确定?
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沙发
发表于 2015-10-6 20:17 |只看该作者
问题能说详细一点吗?
7 u6 a$ h) J9 K# S3 Y- C  S感觉不知道你在问什么。

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藤椅
发表于 2015-10-7 10:40 |只看该作者
回复 xcf20305 的帖子, _! |) t3 w8 G
$ F- n. l3 b' \/ }3 s. \
就是我分离得到了一种蛋白,跑胶显示了它的大小,但是我不知道它的种类是什么,想知道怎么能通过其大小找到它可能的种类。
% c$ p* D9 {4 l5 t这样说的明白了吗?

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板凳
发表于 2015-10-7 11:39 |只看该作者
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回复 听不到 的帖子4 d# [6 s7 H- t& i

4 t& ^$ {0 n3 v( v" K; o7 {如果不知道蛋白质的序列,仅仅知道大小,是不够的。% @8 k7 D  d; A1 H2 t/ [, R0 c
建议:0 O2 `9 o: a7 i- K9 \. C6 g) E6 H! u  \
取该蛋白,打质谱,以获得该蛋白的部分序列,然后通过blastp比对,在NCBI上搜索同源的蛋白,根据大小判断该蛋白的具体信息,如名称,大小,等电点,物种和功能注释信息。
6 G5 H3 b/ _: C$ q2 O
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报纸
发表于 2015-10-7 14:15 |只看该作者
回复 xcf20305 的帖子
6 x4 Q( F5 L) k- Y! P+ ?' A5 c2 c1 Q& u% Q5 q; K) h
好的,谢谢哈~

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地板
发表于 2015-10-8 10:56 |只看该作者
仅仅靠大小不好查找,至少需要知道这个蛋白受哪些因子或者药物调控吧....然后从信号通路上猜猜看~
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发表于 2015-10-8 13:04 |只看该作者
回复 baby00000003 的帖子+ f, f+ D  n8 G: H

: T4 j5 G2 f3 ?唉,现在就是只知道大小...知道是细胞分泌的...别的啥都不知道...

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发表于 2015-10-12 09:46 |只看该作者
看来楼主已经把干细胞培养液中分泌蛋白纯化出来了,恭喜!
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发表于 2015-10-12 16:42 |只看该作者
回复 swtarron 的帖子
* x9 `# b. W  G" q0 [# Z3 f5 s' V3 t2 D( s1 s
哈哈哈被发现了~用的TCA/丙酮法,然而我觉得分泌的微量的比如生长因子之类的估计还是没能沉淀出来,浓缩的蛋白也是非常多,还是难以确定
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