荧光原位杂交（fish）探针设计原则和方法

xxp1246087085

准备做RNA FISH，白手起家啊

l19rna

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4 U% b- Y% [1 I; d, G# k# B5 }: z5 s) c$ `: @" o
兄弟加油，我已经搞定了

xxp1246087085

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! G2 L7 s2 b: x; l, U( a4 I+ p% f
! e( D0 D- N& h1 k以后还要多多请教啊

l19rna

回复 xxp1246087085 的帖子  a! P" ^; Z, Z' n/ ~
! S+ v  P+ T# C. c, W
我现在只会做whole mount ISH of mouse embryo，不知道能不能帮到你了，呵呵

xxp1246087085

回复 l19rna 的帖子& m4 m$ J1 a. P5 b( ^  J( D! q

0 k7 P7 w) a$ h/ [我现在设计的500bp长度的探针，末端会有1-2bp的不匹配序列，不知道对结果有影响没有，我用的RNA探针

l19rna

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2 b( A- |+ N. x  J% j# P# R, B
9 S2 s  B' h* U' X! n木有影响，放心吧。你做体外转录时候还有载体上的一小部分序列呢，不会影响结果的

flybear

FISH要求的长度是1000-1200bp左右吧，如果做细胞的可能要考虑你的转化效率了！！！片段太短，特异性很差，这个楼主要考虑了！！！

flybear

做这种fish，先弄最好做的，比如actin等，做个阳性对照了！！！出来了，再做目的基因的！！！！

l19rna

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' n- k5 G9 w1 R3 ]% Z3 {* n+ F& q5 m
嗯嗯，非常感谢分享经验

xxp1246087085

谢谢大家，这两天忙考试了，没上网，非常感谢