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JCO:区分甲状腺结节的良恶性,南方科技大学团队开发的这个方法灵敏度高达100%! [复制链接]

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发表于 2023-1-30 23:11 |只看该作者 |正序浏览 |打印
JCO:区分甲状腺结节的良恶性,南方科技大学团队开发的这个方法灵敏度高达100%!
0 N: N2 s! Y6 i# Q$ [1 Q  l来源:奇点糕 2023-01-30 14:52
* X$ O1 g+ l9 i基于印迹基因的QCIGISH检测在区分甲状腺结节良恶性上具有很高的诊断效能,其对恶性结节很高的阴性预测值证明其在排除恶性肿瘤上非常有效,同时,很高的阳性预测值可使得其作为一种有效的检测方法  d9 Y+ ?: z$ ~% n3 z
甲状腺结节的患病率很高,在成人群体中以超声检查方式统计的患病率为70%,其中约5%的结节是恶性的[1],而良恶性结节的治疗方式及预后差别巨大。因此,准确判断甲状腺结节的良恶性对于其临床管理至关重要。
& O: F: s* s, M0 s目前,超声影像学联合细针穿刺(FNA)活检是甲状腺结节诊断的主要方法,但约20%-30%的甲状腺结节仍无法通过这种方法确定性质[2]。因此,急需开发新的检测方法以提高其诊断精确度。3 c- ~! V/ O6 g9 w
基于生物标志物的肿瘤检测,极大地改变了肿瘤检测的格局,其中基因组印迹作为肿瘤发生过程中的表观遗传标志物,与多种肿瘤的发生关系密切[3],然而这种基因印迹的检测却存在较高的技术壁垒。1 p) t, b$ g1 n' t9 M5 m# p
近日,由南方科技大学邢明照教授领衔的研究团队在Journal of Clinical Oncology发表了一项重要研究成果。研究发现,基于印记生物标志物的检测可有效区分良恶性甲状腺结节,尤其对于甲状腺恶性结节,敏感性高达100%[4],表明基于印迹基因的新检测方法,在甲状腺结节的临床诊断方面具有很高的潜力。$ h& i. u0 L) [3 T0 Q
6 C( l6 L* O3 ^1 b1 I9 l
图1. 文章封面截图5 P9 q. ~& [9 Y, E4 z9 [
研究人员纳入了中国科学院大学肿瘤医院等8个大型医疗中心550名甲状腺结节患者的病理标本,其中124例(82例恶性结节和42例良性结节)为术后石蜡标本,用于初步诊断模型的构建,32例(8例恶性结节和24例良性结节)为术前甲状腺穿刺标本、用于模型优化,394(117例恶性结节和277例良性结节)例为术后组织病理学的穿刺样本,以进行前瞻性验证研究(图2)。
" G2 \$ y1 X' K6 R) R* x   Y$ k1 S# a4 D0 p1 ^! [
图2. 研究设计和流程图
; Y- J, N' [$ n  g* o/ L3 K由于印迹基因检测存在较高的技术难度,因此,如何完成这550例样本的印迹基因检测就成了研究的核心。  s; X# C' R) w. o# }0 m
RNA原位杂交(ISH)方法是检测印迹和非印迹基因的转录调控的传统技术[5],为了精确定量印迹基因,研究人员基于这种传统技术,开发出一种更为先进的定量显色印迹基因原位杂交技术(QCIGISH),并鉴定出三个具有癌症诊断潜力的印迹基因:鸟嘌呤核苷酸结合蛋白-α刺激复合物位点(GNAS),生长因子受体结合蛋白(GRB10)和小核核糖核蛋白多肽N(SNRPN)[6]。
0 o: H% |: g/ K/ m# m9 l/ m那基于QCIGISH检测这些癌症特异性印迹基因,是否可以准确判断出甲状腺结节的良恶性呢?! Y# Z; ?! F9 q" K3 V* Z
基于QCIGISH检测技术,研究人员使用靶向GNAS、GRB10、SNRPN和HM13非编码内含子序列的探针进行印迹基因检测,并测量其双等位基因表达(BAE)、多等位基因表达(MAE)和总表达(TE)来对印迹基因的灵敏性和特异性进行客观定量(图3A)。随后,研究人员通过结节组织连续切片进行QCIGISH检测和HE染色,以分析这四种印迹基因表达与甲状腺结节良恶性的相关性(图3B)。8 j$ R" N: y, W  N8 u  Y% t8 ^9 C

' w1 y7 |! ^/ c图3. QCIGISH的原理-印迹基因等位基因表达状态的可视化、定量和病理确认, _/ Y9 y" b6 o
完成初始化模型构建和模型优化后,研究人员对394例用于前瞻性验证的临床样本进行了QCIGISH临床适用性的测试,发现超声检查ACR TI-RADS分类中3-5级结节中组织病理恶性肿瘤率随级别增加逐渐升高,Bethesda分型也发现级别越高恶性肿瘤率也越高。; u1 ]0 \" |/ Q' m5 O
随后,研究人员以组织病理学诊断作为标准,评估了QCIGISH分级模型的诊断效能:QCIGISH诊断甲状腺恶性结节的总体敏感性为100%,良性结节的特异性为91.5%,总体阳性预测值(PPV)为96.5%,恶性肿瘤的阴性预测值(NPV)为100%(图4),相应的总体诊断准确率为97.5%(384/394)。3 V; k" n' n7 o4 E* \

4 Y9 p4 M' L5 ~, ]) ^图4. QCIGISH诊断甲状腺结节的诊断效能
% k* ~* x2 [1 N: R$ t接下来,研究人员评估了QCIGISH在不同Bethesda分型患者中的诊断效能:
; d7 r3 L, }" _0 f) t9 B' `5 t对于Bethesda II型甲状腺结节,100%(83/83)的QCIGISH阴性病例为组织病理学良性,而42.9%(6/14)的QCIGISH阳性病例为组织病理学恶性(图5D);9 w9 L9 n2 z1 e4 \! G# M  }
对于Bethesda III和IV型甲状腺结节,QCIGISH阴性病例中100%(23/23)为组织病理学良性结节,QCIGISH阳性病例中96.6%(56/58)为组织病理学恶性结节,PPV为96.6%,NPV为100%(图5E),诊断恶性甲状腺结节的总体准确率为97.5%(79/81);6 p. b& o4 R( O# q$ m. j
对于Bethesda V型甲状腺结节,仅一例为QCIGISH阴性且为组织病理学良性结节,而100%(31/31)的QCIGISH阳性病例为组织病理学恶性结节(图5F);
/ J: Y6 r  L: Y4 V3 a对于Bethesda VI型甲状腺结节,100%(184/184)的QCIGISH阳性病例为组织病理学恶性结节(图5G)。9 B9 N9 o: p" p, s" h! w3 x" o
4 o) T- L$ c, C- d
图5. QCIGISH诊断不同Bethesda分型甲状腺结节的诊断效能0 ~: k  A5 A6 w
综上所述,基于印迹基因的QCIGISH检测在区分甲状腺结节良恶性上具有很高的诊断效能,其对恶性结节很高的阴性预测值证明其在排除恶性肿瘤上非常有效,同时,很高的阳性预测值可使得其作为一种有效的检测方法,以辨别细胞学上不确定的甲状腺结节。这项研究提供了一种新的甲状腺分子诊断检测方法,或可改变甲状腺临床诊断的格局。
7 ^% E& x6 B9 T+ T+ \# j参考文献:& u  w3 O) |. Q- ^8 B- c+ L
[1] Guth S, Theune U, Aberle J, et al. Very high prevalence of thyroid nodules detected by high frequency (13 MHz) ultrasound examination. Eur J Clin Invest. 2009 Aug;39(8):699-706. doi: 10.1111/j.1365-2362.2009.02162.x.
: b- ~5 X0 k, v/ X( z[2] Wang CC, Friedman L, Kennedy GC, et al. A large multicenter correlation study of thyroid nodule cytopathology and histopathology. Thyroid. 2011 Mar;21(3):243-51. doi: 10.1089/thy.2010.0243.  % F0 A/ d" c& w9 Y! I+ A
[3] Jelinic P, Shaw P. Loss of imprinting and cancer. J Pathol. 2007 Feb;211(3):261-8. doi: 10.1002/path.2116.0 v% E# B$ [* |+ N7 B
[4] Xu H, Zhang Y, Wu H, et al. High Diagnostic Accuracy of Epigenetic Imprinting Biomarkers in Thyroid Nodules. J Clin Oncol. 2022 Nov 15:JCO2200232. doi: 10.1200/JCO.22.00232.
3 h; Z7 [. Q+ F2 X1 P* k[5] Kohda A, Taguchi H, Okumura K. Visualization of biallelic expression of the imprinted SNRPN gene induced by inhibitors of DNA methylation and histone deacetylation. Biosci Biotechnol Biochem. 2001 May;65(5):1236-9. doi: 10.1271/bbb.65.
6 N& _8 K- c) Q7 Z[6] Shen R, Cheng T, Xu C, et al Novel visualized quantitative epigenetic imprinted gene biomarkers diagnose the malignancy of ten cancer types. Clin Epigenetics. 2020 May 24;12(1):71. doi: 10.1186/s13148-020-00861-1. & u: Q9 y8 |3 ~0 T; I
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