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[请教] 请教一下race技术 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-6-26 10:28 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
我已知这个基因的CDNA片段长只有700多,预测基因全长CDNA是1万的样子。可以以这700为基础,通过3'和5'race得到这全长的序列然后测通吗?
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沙发
发表于 2011-6-26 10:55 |只看该作者
说实话我没有看明白你的意思!前面的700cDNA是指什么?不包含内含子?1W又指什么?RACE只是帮组你确定基因的5‘转录起始位点和3’终止位点的,用RACE只能得到5‘端和3’端,而如何得到全长?如果要得到全长cDNA,那只需要用polydT反转录加PCR就可以得到全长cDNA,如果要测基因组上整个基因的片段,在cDNA的序列基础上设计引物做PCR就可以,如果太长的片段无法PCR,可以设计成段的引物做walking!
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藤椅
发表于 2011-6-26 19:31 |只看该作者
问一下,你的700bp的片段是距离5’端还是3’端更近些,扩增难度估计要大一些,为什么不采用其它方法先延伸你的目的片段,然后再做RACE呢,本人觉得可能直接用RACE来扩增从现有目的片段获取整个完整序列比较困难,以上只是个人观点,仅供参考。
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