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有关于Real-time PCR的标准曲线问题 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-11-20 00:42 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
大家好,本人初次提问,希望有相关经验的好友给予帮助!谢谢!3 G: |7 W- ~1 v' b+ I; R. q
我想问:提取RNA再反转录成cDNA,在Real-time PCR中选择相对定量方法,制作标准曲线时,是用cDNA梯度稀释还是反转录前的RNA梯度稀释?哪个效果会比较好?
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包包
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沙发
发表于 2011-11-20 18:50 |只看该作者
     以RNA为模板是P不出来产物的,若有条带,那说明你提的产物有基因组污染,是不能做后期分析的,除非你用的反转录试剂盒里含Dnase那就另说了,这就是RT中的No RT control。标准的做法是以cDNA为模板做标曲,因为其可以更真实的反映模板的扩增环境。但是这样做会消耗大量的cDNA,这就意味着你需要制备大量的样品,会非常麻烦。一般我们会选择以cDNA为模板,用你的待测和内参基因分别做2次普通PCR再纯化,以收集大量的纯化片段,再以此为模板做标准曲线。
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藤椅
发表于 2011-11-20 21:02 |只看该作者
回复 zerollx 的帖子
; I1 q/ ]1 a$ M- @
  `7 S3 M/ h. C4 U: h必须要纯化吗?我一般反转成cDNA就直接上机做RT-PCR了啊
4 s6 ]2 o- d$ w
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板凳
发表于 2011-11-20 22:14 |只看该作者
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zerollx的意思是做标曲时利用普通PCR扩增的目的片段最好纯化,这样可以更好的清楚你的目的片段浓度,而且杂质少。样品的RT-PCR可以直接拿反转录的cDNA上机。
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报纸
发表于 2011-11-20 22:18 |只看该作者
楼上正解。。。
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