有什么软件可以预测与顺式作用元件相互作用的转录因子

runsong

我想预测一个基因受哪些转录因子的调控，用软件及数据库的话应该怎样做。
1 v# j# W1 J+ U# n希望各位前辈给以指点。

tonyp0720

http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
- B* ~; @8 D+ r% _宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统  这个网址个人觉得比较有用。

fguw

Try this website , http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html
3 v6 P' i3 b- N7 k4 s- l7 A! sit could provide some information, but  not perfect
' }6 n+ l' c3 l/ T9 U/ VWhile I tried other websites, it looks only this one works
  E0 [+ u' [5 o6 E

kosmos.y

http://www.geneontology.org/到这里吧，GO很强大。包含数据库和工具。很多生物信息学分析都是用它的，蛋白的pathway分析什么的，它很好用

tanguixiang

顶一楼 ，TESS很不错的

runsong

回复 tonyp0720 的帖子
2 H" I; t- }" o0 {7 V' q, S2 s4 D
* K, B, i' t5 n3 G- k" c: a" _# b十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

tonyp0720

runsong 发表于 2011-9-3 13:31
) ^$ W* T! f( T, _8 A1 Y0 C回复 tonyp0720 的帖子
8 ~2 J9 D3 Q, d" ?; S0 ]) Y% s6 \- d6 b& r3 ^8 d" W1 w2 W
十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

- A9 l" g8 x+ I你点击 site searches ,进入它的页面，在DNA sequence 里面拷贝你的序列，其他的一般不需要改动，点击submit即可。也可以看下面的每条提供的解释，根据你试验来选择。这样说不知道你明白不。